Công tác phối hợp giữa hai ngành đã thống nhất từ Trung ương đến các địa phương, cơ sở. Tuy nhiên, theo Thứ trưởng Bộ GD-ĐT Trần Quang Quý, nhận thức của một số nhà trường về vị trí, vai trò của công tác đảm bảo an ninh, trật tự trường học và những vấn đề nhạy cảm trong học sinh, sinh viên dễ phát sinh thành điểm nóng còn chưa sâu sắc, nhạy bén, dẫn đến việc thiếu quan tâm, đầu tư thỏa đáng cho công tác này.